Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf3B2RUQ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf3B2RUQ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms