Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1B2KF50 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms