Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Mbd5B1AYB6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mbd5B1AYB6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms