Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem235B1AQL3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Tmem235B1AQL3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Tmem235B1AQL3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem235B1AQL3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Tmem235B1AQL3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Tmem235B1AQL3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Tmem235B1AQL3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem235B1AQL3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Tmem235B1AQL3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Tmem235B1AQL3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms