Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap221A9Q751 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cfap221A9Q751 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms