Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan16A2ALW2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan16A2ALW2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms