Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmcn2A2AJ76 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hmcn2A2AJ76 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms