Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C87977A2A958 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87977A2A958 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87977A2A958 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87977A2A958 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87977A2A958 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C87977A2A958 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C87977A2A958 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms