Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU1

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDU1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A0A286YDU1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A286YDU1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A286YDU1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A286YDU1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A286YDU1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A286YDU1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A286YDU1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A286YDU1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms