Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms