Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp2lA0A0M3U1B0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms