Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W3

Ighv1-53, Immunoglobulin heavy variable 1-53 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-53A0A075B5W3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms