Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms