Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.4 ms