Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CsprsQ99388 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms