Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms