Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Ercc8Q8CFD5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Ercc8Q8CFD5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Ercc8Q8CFD5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Ercc8Q8CFD5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Ercc8Q8CFD5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ercc8Q8CFD5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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