Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms