Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zmat1Q3V0C1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms