Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms