Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms