Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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