Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sox10Q04888 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox10Q04888 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms