Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmod1P49813 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmod1P49813 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmod1P49813 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmod1P49813 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmod1P49813 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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