Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms