Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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