Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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