Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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