Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm3250E9Q1M3 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm3250E9Q1M3 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm3250E9Q1M3 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Cab39l-206ENSMUST00000225595 1380 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm3250E9Q1M3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm3250E9Q1M3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm3250E9Q1M3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms