Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnk1dQ9DC28 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnk1dQ9DC28 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnk1dQ9DC28 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnk1dQ9DC28 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnk1dQ9DC28 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnk1dQ9DC28 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Csnk1dQ9DC28 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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