Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc83Q9D4V3 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms