Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CYI0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms