Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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