Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pacsin3Q99JB8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pacsin3Q99JB8 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pacsin3Q99JB8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pacsin3Q99JB8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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