Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx18Q8VDS8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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