Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scara5Q8K299 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scara5Q8K299 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scara5Q8K299 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scara5Q8K299 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scara5Q8K299 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scara5Q8K299 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scara5Q8K299 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scara5Q8K299 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scara5Q8K299 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Scara5Q8K299 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Scara5Q8K299 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Scara5Q8K299 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Scara5Q8K299 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Scara5Q8K299 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scara5Q8K299 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scara5Q8K299 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scara5Q8K299 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scara5Q8K299 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms