Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms