Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mdc1Q5PSV9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mdc1Q5PSV9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mdc1Q5PSV9 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mdc1Q5PSV9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mdc1Q5PSV9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mdc1Q5PSV9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mdc1Q5PSV9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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