Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms