Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms