Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18529 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18529 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms