Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbbP0CG49 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms