Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cfdp1O88271 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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