Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms