Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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TapbpQ9R233 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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