Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tmigd1Q9D7L8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tmigd1Q9D7L8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tmigd1Q9D7L8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmigd1Q9D7L8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmigd1Q9D7L8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmigd1Q9D7L8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmigd1Q9D7L8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms