Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a8Q99N10 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Ms4a8Q99N10 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms