Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms