Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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