Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Defa20Q45VN2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms